El Ministerio de Sanidad ha establecido la meta de que la futura Agencia Estatal de Salud Pública (AESAP) esté "plenamente operativa" para el primer semestre de 2026. Este proceso se iniciará oficialmente en septiembre con un acuerdo del Consejo de Ministros, marcando el comienzo de la elección de su sede. Los ayuntamientos y gobiernos autonómicos tendrán un plazo de tres meses para presentar candidaturas, conforme al Real Decreto 209/2022. Se espera que la ciudad anfitriona de la AESAP se anuncie en diciembre, siendo Oviedo, Barcelona, Zaragoza, Granada, León y Lugo algunas de las ciudades que ya han manifestado su interés públicamente.

En paralelo a la elección de la sede, se tramitará por vía de urgencia la aprobación del estatuto de la AESAP, previéndose su finalización en un plazo de tres a cuatro meses. Una vez establecidos la sede y el marco jurídico, se procederá a la designación del Consejo Rector y la Dirección General de la Agencia. El objetivo fundamental de la AESAP es consolidar una infraestructura estable para anticiparse a futuras crisis sanitarias, reforzar la vigilancia epidemiológica y mejorar la coordinación con comunidades autónomas e instituciones internacionales, propósito que se hizo evidente tras la pandemia de COVID-19. Asimismo, se llevarán a cabo en paralelo trabajos logísticos como el acondicionamiento de espacios y el traslado de personal para asegurar el inicio de sus actividades.